Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc178Q8CDV0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc178Q8CDV0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms