Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hdac7Q8C2B3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms