Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pm20d1Q8C165 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pm20d1Q8C165 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms