Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Atg16l1Q8C0J2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg16l1Q8C0J2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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