Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Arhgef17Q80U35 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Arhgef17Q80U35 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Arhgef17Q80U35 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Arhgef17Q80U35 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Arhgef17Q80U35 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Arhgef17Q80U35 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Arhgef17Q80U35 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Arhgef17Q80U35 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arhgef17Q80U35 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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