Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Fam220aQ3ZN08 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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