Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx27Q3UHD6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms