Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ctdnep1Q3TP92 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctdnep1Q3TP92 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdnep1Q3TP92 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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