Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Ttc21bQ0HA38 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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