Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aplp2Q06335 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Aplp2Q06335 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms