Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snai1Q02085 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms