Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gfra1P97785 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms