Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd13P70217 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd13P70217 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd13P70217 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxd13P70217 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd13P70217 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxd13P70217 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxd13P70217 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxd13P70217 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Hoxd13P70217 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxd13P70217 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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