Protein–RNA interactions for Protein: P57071

PRDM15, PR domain zinc finger protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15P57071 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDM15P57071 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDM15P57071 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms