Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxc13P50207 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hoxc13P50207 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxc13P50207 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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