Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtpreP49446 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms