Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa35E9QLQ1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa35E9QLQ1 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa35E9QLQ1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa35E9QLQ1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa35E9QLQ1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Defa35E9QLQ1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms