Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myo5cE9Q1F5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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