Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gria4Q9Z2W8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gria4Q9Z2W8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gria4Q9Z2W8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms