Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt16Q9Z2K1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt16Q9Z2K1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms