Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SnapinQ9Z266 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SnapinQ9Z266 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SnapinQ9Z266 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnapinQ9Z266 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnapinQ9Z266 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SnapinQ9Z266 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SnapinQ9Z266 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms