Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rs1Q9Z1L4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rs1Q9Z1L4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rs1Q9Z1L4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rs1Q9Z1L4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rs1Q9Z1L4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rs1Q9Z1L4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rs1Q9Z1L4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rs1Q9Z1L4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rs1Q9Z1L4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms