Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn8aQ9WTU3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn8aQ9WTU3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn8aQ9WTU3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn8aQ9WTU3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn8aQ9WTU3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn8aQ9WTU3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn8aQ9WTU3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn8aQ9WTU3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scn8aQ9WTU3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Scn8aQ9WTU3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scn8aQ9WTU3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms