Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf103Q9R1W3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf103Q9R1W3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf103Q9R1W3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf103Q9R1W3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf103Q9R1W3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms