Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb2Q9R1P3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb2Q9R1P3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb2Q9R1P3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms