Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcm1Q9R0L6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcm1Q9R0L6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcm1Q9R0L6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms