Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr2e3Q9QXZ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr2e3Q9QXZ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr2e3Q9QXZ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms