Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apbb1Q9QXJ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Apbb1Q9QXJ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apbb1Q9QXJ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms