Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msh5Q9QUM7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Msh5Q9QUM7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msh5Q9QUM7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms