Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfx5Q9JL61 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rfx5Q9JL61 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx5Q9JL61 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms