Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace2Q9JL18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace2Q9JL18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms