Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Alyref2Q9JJW6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Alyref2Q9JJW6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Alyref2Q9JJW6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Alyref2Q9JJW6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Alyref2Q9JJW6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Alyref2Q9JJW6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Alyref2Q9JJW6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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