Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssna1Q9JJ94 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssna1Q9JJ94 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssna1Q9JJ94 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms