Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MkksQ9JI70 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MkksQ9JI70 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MkksQ9JI70 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MkksQ9JI70 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms