Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ropn1Q9ESG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ropn1Q9ESG2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms