Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm7Q9ESD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm7Q9ESD6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cmtm7Q9ESD6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cmtm7Q9ESD6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm7Q9ESD6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm7Q9ESD6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms