Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chrnb2Q9ERK7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrnb2Q9ERK7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrnb2Q9ERK7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms