Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI2

Rab27a, Ras-related protein Rab-27A, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27aQ9ERI2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab27aQ9ERI2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab27aQ9ERI2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms