Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc28a3Q9ERH8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc28a3Q9ERH8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc28a3Q9ERH8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms