Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rpgrip1Q9EPQ2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms