Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB8

Isca2, Iron-sulfur cluster assembly 2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isca2Q9DCB8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Isca2Q9DCB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Isca2Q9DCB8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Isca2Q9DCB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms