Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ergic1Q9DC16 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ergic1Q9DC16 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.6 ms