Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cyp27a1Q9DBG1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp27a1Q9DBG1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms