Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med29Q9DB91 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Med29Q9DB91 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Med29Q9DB91 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms