Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fundc1Q9DB70 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms