Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf580Q9DB38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf580Q9DB38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms