Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnn3Q9DAW9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnn3Q9DAW9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms