Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA19

Cir1, Corepressor interacting with RBPJ 1, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cir1Q9DA19 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cir1Q9DA19 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cir1Q9DA19 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cir1Q9DA19 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms