Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9E9

1700086D15Rik, RIKEN cDNA 1700086D15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700086D15RikQ9D9E9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700086D15RikQ9D9E9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
1700086D15RikQ9D9E9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
1700086D15RikQ9D9E9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms