Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot8Q9D8X5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot8Q9D8X5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot8Q9D8X5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms